Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX13Q92968 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms