Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT35Q92764 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT35Q92764 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms