Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN4Q92575 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN4Q92575 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms