Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC1Q92574 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC1Q92574 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms