Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSPC1Q8WXF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
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