Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF31Q8WWY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF31Q8WWY3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF31Q8WWY3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms