Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBLCP1Q8WVY7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBLCP1Q8WVY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms