Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST2Q8WVJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms