Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAT3Q8TDW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAT3Q8TDW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAT3Q8TDW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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