Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPBAR1Q8TDU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPBAR1Q8TDU6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms