Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG3L4Q8TBR4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms