Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL2Q8NHH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms