Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATAD1Q8NBU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATAD1Q8NBU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD1Q8NBU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms