Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87AQ8NBN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM87AQ8NBN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms