Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLRC2Q8NBF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NHLRC2Q8NBF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms