Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF557Q8N988 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF557Q8N988 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF557Q8N988 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms