Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPA2Q8N8Q9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPA2Q8N8Q9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms