Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00612Q8N6U2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00612Q8N6U2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms