Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms