Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SFRP1Q8N474 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP1Q8N474 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP1Q8N474 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms