Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHTF2Q8N3S3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms