Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC105Q8IYK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms