Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALM2Q8IXS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2Q8IXS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms