Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC117Q8IWD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC117Q8IWD4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms