Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A9Q8IVB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms