Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNGA4Q8IV77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA4Q8IV77 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms