Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM25Q86YD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms