Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALB2Q86YC2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALB2Q86YC2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms