Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV6

TMEM173, Stimulator of interferon genes protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM173Q86WV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM173Q86WV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM173Q86WV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM173Q86WV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms