Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD163Q86VB7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD163Q86VB7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms