Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPAINQ86UA6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms