Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF5Q86SE9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF5Q86SE9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms