Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG9AQ7Z3C6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG9AQ7Z3C6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms