Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC29A4Q7RTT9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms