Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX7Q7RTT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms