Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTF1AQ7RTS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTF1AQ7RTS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTF1AQ7RTS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms