Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2BQ7L1I2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms