Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYS1Q717R9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYS1Q717R9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms