Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP45Q70EL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP45Q70EL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP45Q70EL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms