Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC23Q6ZST2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC23Q6ZST2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms