Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms