Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC73Q6ZRK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC73Q6ZRK6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC73Q6ZRK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms