Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPOCD1Q6ZMY3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms