Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VITQ6UXI7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VITQ6UXI7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms