Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL17Q6UXB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms