Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRAT1Q6PJG6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRAT1Q6PJG6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms