Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTR9Q6PD62 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms