Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK5Q6P3R8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK5Q6P3R8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms