Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC42EP5Q6NZY7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms