Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms